DNAシークエンサーやゲノム編集技術をはじめとする様々な実験技術の革新的な進歩により、多様な情報を持つ生命科学データがハイスループットに得られるようになった。 このような大規模高次元の生命データに対し、情報・数理の視点から生命現象の理解を目指すとともに、再生医療や個別化医療などへの応用研究を行う。

　１つ１つの細胞の網羅的な遺伝子発現量である1細胞RNA-seqデータから、細胞運命や遺伝子発現のダイナミクスに関する研究を行っている。

• 細胞の分化過程を再構築し、そのダイナミクスを解析する。
• 再構築した細胞分化の過程から、制御ネットワークを推定する。
• 未知の転写構造とその発現変化を発見する。

　血液中に含まれる疾患特異的なmiRNAを特定する。そのうえで、それらmiRNAがどのような代謝機能と関連するかを特定し、疾患の要因の解明を目指す。